Да, с этой проблемой тоже сталкивался на сервере одного пользователя, косяк был именно в комментариях, при чем поигравшись доходило до того, что мешал один символ U. Явно что-то не так с кодировками, но особо не разобрались. На моих серверах таких проблем не возникало, но многие комменты из шаблонов решил в итоге поудалять.

Спасибо за подсказку. При смене шаблона на пустой все заработало. Как Вы и предположили, дело в Смарти… Уж не знаю, в чем конкретно, но мой Смарти просто отказывается кушать свои же длинные комментарии, особенно многострочные больше 2-3 строк, типа {*…
 …
 …
 …
 *}
 
После долгого копания поудалял или сделал однострочными такие комменты в шаблонах layout.tpl, inc/modals/login.tpl и inc/login/login.tpl — это как минимум, чтобы заработала mainpage.
 
Всего наилучшего

Скорее всего никак. Все это дело на совести установщика. Да, я попробовал сейчас пересортировать менюшки и обновиться. Системные менюшки по-моему все встали обратно. Но вы можете перед обновлением сделать выгрузку таблицы действий, а после обновления затереть ее своим дампом, тогда ОК Будет. Да, не круто это, но что делать?

В beforeSave() получения объекта заказчика можете переписать вместо $this->getContractor():
 
if (
    $contractor =  $this->getContractor()
    AND $phone = $this->getProperty('phone')
){
    $contractor->Profile->phone = $phone;
    $contractor->setDirty();
}

Здравствуйте, Николай!
 Дело в том, что данный параметр я изменил и теперь предупреждение не появляется, и заказы от одного клиента (с одинаковым e-mail) добавляются.
 Проблема в том, что если один и тот же клиент напишет разные номера телефонов в разных заказах, то администратор интернет магазина, т.е я, будет видеть только один телефон тот, который этот клиент забил в первый раз.
 Например: я сделал первый заказ, оформил его, мой e-mail: test@mail.ru, номер телефона 111-11-11, затем я сделал второй заказ с тем же e-mail: test@mail.ru, но номер телефона теперь другой: 222-22-22, этот заказ был принят
 Но, в «панеле управления заказами» администратор увидит эти два разных заказа, но с номером телефона 111-11-11 и этот номер теперь привязан к e-mail:test@mail.ru
 Как сделать так, чтобы менялся номер телефона в разных заказах от клиента с одинаковым e-mail?

Измените вот этот параметр с false на true. Поможет.

Подскажите, пожалуйста, как можно обновить advanced-версию, чтобы не перезаписывались верхние пункты меню? (вообще с ними беда — при каждом обновлении дополнения, добавляющего аналогичный пункт, старый (при перемещении или переименовании) летит в трубу).

Упали. Спасибо! :)