Дима, привет!

1. Не придумывай параметры запроса сам. Заходи в API и смотри документацию. Нет запроса типа price:!= (как в модексе), но есть price_not, price_gt и price_gte. http://joxi.ru/Vm6a53Mt43k1kr

2. Твой запрос будет примерно так выглядеть:
query beers { beers( where: { name_in: [ "Spaten", "Paulaner Hefe-weissbier", ], places_some:{ price_gt: 0 } } ) { id name places( orderBy: price_ASC, first: 24 where: { price_gt: 0 } ) { price Place { name address place_id url_name image } } } }
Но смотри, тут сразу два условия прописано, потому что выборка идет пива, но цены указаны в связке пиво-заведение, поэтому по первому условию мы находим пиво, у которых цена имеется хоть в одном заведении, но могут быть записи, где цены нет (в одном цена указана, а в другом, это же пиво, нет). Вторым условием мы получаем только те заведения, в которых указана цена для этого пива.
Если указать не places_some, а places_every, то он найдет пиво, у которого во всех заведениях указана цена, и можешь часть выборки потерять.