Сидит. Но суб-модулем. То есть это гит-проект в гит-проекте. И когда ты говоришь про гит, докер сюда не примешивай. Это разные вещи и разные уровни. Докер обеспечивает контейнеризацию, а гит - версионность файлов. И если гит еще хоть как-то может использоваться докером (для скачивания исходников проектов), то гит о докере вообще ничего не знает.

Вспоминай вот этот коммент.

Мы стягивали гит-проект с субмодулями. Вот здесь можно увидеть эти модули: https://github.com/Pivkarta/docker/blob/af08a8295e448d09438bad1faa3971eec5574df1/.gitmodules

Можно и командой увидеть
git submodule status

То есть для того, чтобы закоммитить изменения в проект-субмодуле, надо зайти в папку этого субмодуля. В данном случае в prisma-cms/pivkarta.ru-2

А когда ты выполняешь гит-команды в проекте, в котором имеются субмодули, то он тебе только говорит о том, что есть там изменения или нет. Но не говорит какие. И не закоммитит в себя, если там изменения незакоммиченные.