Попробуйте в админке открыть для редактирования любой документ, после чего в адресной строке смените id=N на id=1. Должна открыться главная страница для редактирования. Но лучше всего посмотреть в БД в таблице modx_site_content. Найдите запись с id 1 и посмотрите какой контекст указан (class_key), какой родитель (parent) и т.п. Возможно документ перетащили случайно в другой раздел и все.