Вот и здорово :)
Только ht.access тут не при чем. Он с таким названием вообще не учитывается и не используется. Просто лежит для примера (поставляется вместе с дистрибутивом MODX-а). А вот когда вы его переименовываете в .htaccess, то этот файл уже подхватывается сервером Apache и используются прописанные в нем конфигурации, в том числе и правила подмены УРЛов.