Добрый день!
Я не могу дать универсальный рецепт по переносу, так как каждый проект на MODX-е все-таки выполняется индивидуально, и 10 сайтов на минишопе могут быть в итоге абсолютно по разному разработаны. Тем не менее мы уже довольно много магазинов перенесли как с минишопа, так и с шопкипера (да и просто с самописок), так что задача вполне решаемая. Киньте в личку ссылку на свой магазин, а так же вкратце напишите про самые сложные модули и задачи, которые там были введены или хотелось бы ввести, но не получается. Я тогда оценю сложность или не сложность переезда в целом.