1. В каких директориях порекомендуете хранить шаблоны smarty и статичные ресурсы (чанки, шаблоны)? От чанков советую отказываться в принципе, тем более статических.
 А для шаблонов (если речь о статических php-шаблонах) — ставьте modxSite, там создается источник файлов Controllers. Вот там им и место (обычно Ему, так как на все хватает одного общего php-контроллера). 2. Где можно посмотреть документацию по modxSmarty, которая демонстрировалась в примере? Там примеры, как в тэгах Smarty вызывать чанки, шаблоны и др… Очень подробный топик на эту тему: modxclub.ru/blog/dokumentatsiya-dlya-spetsialistov/147.html
 С видюшкой. А так смотрите все топики то тегу modxSmarty.