Ошибка возникает.
Вот этот вариант работает нормально:
{block name="sub_menu"} {if $navdata = $modx->runSnippet("pdoMenu", [ 'parents' => $modx->resource->parent, 'level' => 1, 'where' => json_encode([ "isfolder" => 1 ]) ])} <nav class="sub-menu">{$navdata}</nav> {/if} {/block}