MIGX довольно капризен порой. Плагин очень мощный, но документации катастрофически мало.
Там надо внимательно все массивы данных (JSON) перепроверять. Я один раз MIGX_id'шки некорректно указал, и все развалилось. А еще как-то раз, я все перепроверил 10 раз, но никак он не хотел работать — так вот мне разраб MIGX, который Bruno, пояснил, что необходимо в некоторых случаях, дополнительно указывать контроллеры в некоторых полях этих самых JSON'ов, для нужного поведения плагина (но это правда к админке относится). В доках вообще ни слова об этом нет, только на форуме.
Тут Александр совершенно прав — выкладывайте чанк, формирующий внутренний MIGX-массив, проблема, скорее всего, в нем.