Скидка указывается в процентах и учитывается на весь заказ. То есть пока нельзя указать отдельным товарам размер скидки будет неплохо сделать:

1. скидка на все товары
2. скидка на определенный каталог товаров
3. скидка на определенный товар при этом 2 и 3 могут взаимосвязаны