modx не дает создать два одинаковых alias
С этим разобрался, надо в настройках отключить проверку дублирования во всех контентах.
А с генерацией ссылок — засада. Была идея — передавать в процессор ключ приоритетного контекста и при формировании списка проверять, нет ли в том контексте такого документа… Но че-то мне кажется, слишком криво и неповоротливо это будет