Про права я говорил, комментируйте исключения в vapor.php перед тем как сделать снимок. По умолчанию пользователи исключаются.
Про «Could not install files from» — судя по всему просто нет прав на запись в папку manager/ (я не беру во внимание странные пути, возможно это просто скрипт так выдает).