Ну теперь все понятно!) Огромное спасибо. Еще по-мелочи взялся настраивать и политики доступа менеджеров к источникам файлов, чтобы они в корне сайта не копошились. Вроде все получилось — Administrators с правами на Filesystem — Media Source Admin, ContentManagers с правами на Картинки — Media Source Admin — Однако менеджеры могут загружать, но не могут удалять файлы? Какая то фича?
upd: похоже все таки, какой-то баг tracker.modx.com/issues/6746, в таком случае легче просто дефолтный источник указать, думаю не будут особо лазить.