Вы не покупаете один тариф, вы покупаете один сайт. Это: одна БД, одно место на сервере, один вход через SSH/SFTP, и одно место для резервных копий. Что вы там с ними делаете — ваше дело. Наверное, можно умудриться установить и 5 MODX по разным директориям, и развести их в конфиге Nginx, но панель управления рассчитывает, всё таки, на одну установку. Учитывая, что у MODX есть контексты, можно сделать до 10 сайтов на одной установке.