Было бы неплохо связать поле «Фокусные фразы» с META keywords, ну тоесть выводить их в body

Это он умеет. У меня так.

Там кроме seoPro есть еще seoTab, который добавляет вкладку, на которой можно много всего настроить, включая видимость в карте сайта и приоритет, есть также указание старой ссылки для страницы, если вдруг она была перенесена. И в seoTab есть еще сниппет выводящий карту сайта с учетом настроек в самом табе, но у меня он как-то странно работает, pdoSitemap выдает больше страниц, видимо из-за того, что не совсем корректно работает с custom resources.