Вполне возможно у вас просто не весь пакет накатился.

1. После такой поломки чаще всего спасает обновление MODX-а. Установите сейчас MODX поверх в режиме обновления.
2. Снапшоты лучше накатывать через консоль. В состав моего модифицированного Vapor-а входит скрипт import.php Скачиваете снапшот-пакет (или закидываете в core/packages) и выполняете через консоль (в винде cmd или far) из корня сайта (или откуда угодно с указанием правильных путей): php vapor/import.php package=core/packages/package~.zip (актуальный путь до пекета). И все, пакет накатится без риска потери сессии и т.п. P.S. так как у вас винда и скорее всего команда php не будет видна глобальна, указываете в этой строке полный путь до php-программы (типа C:/Denver/usr/bin/php5/php.exe или как он там у вас)