ну в данном случае у тебя # устанавливаем ключ-пер

ну в данном случае у тебя

# устанавливаем ключ-переменную для запроса к мемкешу
set  $memcached_key       "default/$uri?$args";

и все! это же касается только memcached. При чем тут реальные файлы? только лишняя переменная=index.php? в ключе